mIRC sobreescribe su fichero de configuración, mirc.ini, al cerrarse. Si no lo cierras y apagas el pc, ocurre que el fichero mirc.ini puede quedarse corrupto, y es ahí donde el mIRC guarda la información de los archivos de script que se están ejecutando.
Por esa razón la siguiente vez que arrancas el IRcap, el mIRC no cargará sus ficheros, y puedes tener desde un mIRC sin script a un IRcap al que le falten varios archivos por cargar y por lo tanto muestre errores de falta de alias y demás, dependiendo de en qué punto el fichero mirc.ini se haya "partido".
Es un problema que viene ocurriendo desde las primeras versiones del mIRC.
No siempre se puede cerrar antes de apagar el pc, por culpa de un cuelgue o un apagón. La forma de arreglarlo es reinstalar el IRcap en el mismo directorio, no hace falta borrar nada antes, sólo sobreescribir los archivos durante la instalación. El IRcap se iniciará con las opciones por defecto, pero preguntará si quieres recuperar la anterior configuración, con lo que se recupera casi todo. Otras opciones tendrán que volver a configurarse a mano. Los logs y ficheros recibidos seguirán ahí. Sólo si no se borra antes de instalar.