Utiliza las protecciones de canales del IRcap
en el menu de canal elige config
te preguntara si quieres crear una configuracion para el canal dale a si
en el dialogo que se abre ve a protecciones, hay veras vastantes protecciones a configurar
si das en el triangulo de al lado de cada una de las opciones que hay tienes podras configurar lo que quieres hacer en cada caso, poner modos, kikear, poner ban etc
Tambien podras añadir niveles, o sea lo que hacer cada vec que se produzca ejemplo:
Nivel 1 avisas, nivel2 haces un kick, nivel 3 pones un ban temporal, nivel 4 pones un ban permanente,
de igual modo puedes actuar con las demas opciones.
Si marcas excluir ops, voz, auto op estos no seran tenidos en cuenta por las protecciones.

De todos modos lo mejor que se puede hacer contra el flood es configurar bien el canal un modo +f bien configurado te quitara problemas mira en http://foroircap.org/ayuda-general-ircap/como-frenar-ataques-de-clones/
Hay se trato sobre el flood
Y aquí he puesto una descripción de los modos +f y +j http://foroircap.org/ayuda-irc-y-otras-cosas-relacionadas/sobre-el-flood/msg992/#msg992

Hola, una muy buena, eficaz y simple opcion es programar tu Bot para que lo aga:
 /MSG BotServ KICK  #canal FLOOD ON  kicks  líneas  segundos  ----> kicks lo cambias por el numero de KICKs antes del ban,  líneas y  segundos van en conjunto, significan que por ejemplo 6 líneas en 8 segundos (se reemplazan con números), si no pones los ultimos 2 el bot activará el comando con 6 líneas máximas en 10 segundos.
ejemplo: /MSG BotServ KICK  #canal FLOOD ON 3 4 8     <-- Dara tres kicks al escribir cuatro lineas seguidas en menos de ocho segundos, espero te sirva de ayuda, saludos.
 
MaCrO